إن أصل الكلمة عربي مبدئياً، ولكنه غريب للغاية.
فيقول ل الخوارزمي في كتابه مفاتيح العلوم: "اسم هذه الصناعة، الكيمياء وهو عربي، واشتقاقه من: كمي يكمى، إذا ستر وأخفى، ويقال: كمى الشهادة يكميها، إذا كتمها."
أي أن أصل الكلمة هو الاخفاء، وسبب هذه التسمية أن الكيمياء قد تتسبب بتحول بعض المواد إلى أخرى وكأنه تم إخفاء المواد القديمة.